Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt1lA2RSY6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1lA2RSY6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1lA2RSY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1lA2RSY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1lA2RSY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt1lA2RSY6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt1lA2RSY6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt1lA2RSY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trmt1lA2RSY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt1lA2RSY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt1lA2RSY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trmt1lA2RSY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1lA2RSY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1lA2RSY6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1lA2RSY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1lA2RSY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms