Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Btbd35f28A2CFD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Btbd35f28A2CFD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Btbd35f28A2CFD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Btbd35f28A2CFD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Btbd35f28A2CFD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f28A2CFD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Btbd35f28A2CFD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Btbd35f28A2CFD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.8 ms