Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Catsper2A2ARP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Catsper2A2ARP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Catsper2A2ARP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Catsper2A2ARP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Catsper2A2ARP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Catsper2A2ARP9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Catsper2A2ARP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Catsper2A2ARP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Catsper2A2ARP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Catsper2A2ARP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Catsper2A2ARP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Catsper2A2ARP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Catsper2A2ARP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms