Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga8A2ARA8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga8A2ARA8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga8A2ARA8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga8A2ARA8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga8A2ARA8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga8A2ARA8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga8A2ARA8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga8A2ARA8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga8A2ARA8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga8A2ARA8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga8A2ARA8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms