Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syndig1A2ANU3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syndig1A2ANU3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syndig1A2ANU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syndig1A2ANU3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syndig1A2ANU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syndig1A2ANU3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syndig1A2ANU3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syndig1A2ANU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syndig1A2ANU3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1A2ANU3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syndig1A2ANU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms