Protein–RNA interactions for Protein: A2AIL4

Ndufaf6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf6A2AIL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf6A2AIL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf6A2AIL4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf6A2AIL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf6A2AIL4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf6A2AIL4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufaf6A2AIL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufaf6A2AIL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf6A2AIL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf6A2AIL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf6A2AIL4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms