Protein–RNA interactions for Protein: A2ACJ2

Faap100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap100A2ACJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Faap100A2ACJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Faap100A2ACJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Faap100A2ACJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Faap100A2ACJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Faap100A2ACJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Faap100A2ACJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Faap100A2ACJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Faap100A2ACJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Faap100A2ACJ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms