Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW38

Gm28870, Predicted gene 28870, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28870A0A0A6YW38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28870A0A0A6YW38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28870A0A0A6YW38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28870A0A0A6YW38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28870A0A0A6YW38 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm28870A0A0A6YW38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28870A0A0A6YW38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28870A0A0A6YW38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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