Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ99

Gm29666, Predicted gene 29666, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29666A0A087WQ99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm29666A0A087WQ99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm29666A0A087WQ99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29666A0A087WQ99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29666A0A087WQ99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29666A0A087WQ99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gm29666A0A087WQ99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gm29666A0A087WQ99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm29666A0A087WQ99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm29666A0A087WQ99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm29666A0A087WQ99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm29666A0A087WQ99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29666A0A087WQ99 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29666A0A087WQ99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29666A0A087WQ99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gm29666A0A087WQ99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm29666A0A087WQ99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gm29666A0A087WQ99 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm29666A0A087WQ99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm29666A0A087WQ99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm29666A0A087WQ99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29666A0A087WQ99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29666A0A087WQ99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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