Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SgshQ9EQ08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms