Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms