Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Esf1Q3V1V3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Esf1Q3V1V3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Esf1Q3V1V3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms