Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms