Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme1P97371 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme1P97371 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms