Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StomP54116 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StomP54116 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StomP54116 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StomP54116 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StomP54116 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
StomP54116 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StomP54116 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
StomP54116 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StomP54116 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
StomP54116 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
StomP54116 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StomP54116 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StomP54116 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StomP54116 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StomP54116 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms