Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NelfeP19426 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NelfeP19426 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NelfeP19426 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms