Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lama1P19137 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lama1P19137 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lama1P19137 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lama1P19137 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lama1P19137 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms