Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms