Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Smad7O35253 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smad7O35253 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Smad7O35253 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smad7O35253 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smad7O35253 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smad7O35253 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smad7O35253 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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