Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms