Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

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Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep350E9Q309 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Cep350E9Q309 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Cep350E9Q309 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Cep350E9Q309 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep350E9Q309 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep350E9Q309 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep350E9Q309 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep350E9Q309 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep350E9Q309 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep350E9Q309 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms