Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 357.1 ms