Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhx6Q9R1R0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms