Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herpud1Q9JJK5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms