Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spdl1Q923A2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Spdl1Q923A2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spdl1Q923A2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spdl1Q923A2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spdl1Q923A2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spdl1Q923A2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms