Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cabp4Q8VHC5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cabp4Q8VHC5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms