Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep57l1Q8VDS7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep57l1Q8VDS7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms