Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700001C19RikQ8K168 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms