Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms