Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd1Q61345 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms