Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox12Q04890 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms