Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod1P49813 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod1P49813 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod1P49813 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod1P49813 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod1P49813 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod1P49813 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod1P49813 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmod1P49813 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmod1P49813 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms