Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spi1P17433 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms