Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx8O88983 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms