Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-ObO35424 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms