Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms