Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms