Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsfQ9R013 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CtsfQ9R013 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsfQ9R013 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsfQ9R013 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsfQ9R013 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtsfQ9R013 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms