Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIQ8

Tmprss2, Transmembrane protease serine 2, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss2Q9JIQ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmprss2Q9JIQ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmprss2Q9JIQ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms