Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tlr1Q9EPQ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms