Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Alkbh4Q9D8F1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms