Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlgn1Q99K10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlgn1Q99K10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms