Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smchd1Q6P5D8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smchd1Q6P5D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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