Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psme4Q5SSW2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms