Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mdc1Q5PSV9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mdc1Q5PSV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mdc1Q5PSV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms