Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms