Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy4Q3TYX8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms