Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim63Q38HM4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms