Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb1P56386 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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