Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms